马克思主义学院是于2015年11月由原思想政治理论课教学部更名成立，是直属于学校领导的二级教学、科研单位。马克思主义学院现有教职工50人，其中专任教师47人，教授4人，副教授23人，讲师20人，博士和在读博士共25人，35岁以下的青年教师比例为34.8%，全部获得硕士以上学位，有多名教师获省南粤优秀教师、校教书育人先进分子、校优秀共产党员荣誉称号。

马克思主义学院下设学院办公室、6个教研室和1个研究中心。教研室和研究中心分别是中国近现代史纲要教研室、毛泽东思想和中国特色社会主义理论概论教研室、马克思主义基本原理教研室、思想道德修养与法律基础教研室、形势与政策教研室、研究生思想政治理论课教研室和华南农业大学广东农村思想文化研究中心。

马克思主义学院教师承担全校本科生、硕士生和博士生的思想政治理论课，以及部分人文素质教育教学任务。根据中宣部和教育部要求，从2006年9月开始在2006级新生中实施“05方案”。实施“05方案”以来，马克思主义学院非常重视课程建设和教学研究。目前，《中国近现代史纲要》、《毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论》、《马克思主义基本原理概论》和《法律基础与思想道德修养》四门课程均是广东省精品资源共享课程。在教学成果方面，获得教育部思想政治理论优秀教案1项，广东省思想政治理论课优秀教学片一等奖1项，三等奖4项；优秀教案二等奖2项，三等奖4项。在广东省首届微课竞赛中获文史组二等奖1项；在2014年广东省高校思政教师暑期社会实践微课优质资源征集活动中获一等奖1项、二等奖2项、三等奖1项；在2014年广东省“百系列”德育优秀成果展中，一人入选百名优秀思政教师，一、二、三等奖各一项。在广东省历届思想政治理论课青年教师教学基本功大赛和华南地区多省（区）的历届思想政治理论课青年教师教学基本功联赛中，获一、二、三等奖共计20余项。

马克思主义学院现有一个“马克思主义中国化研究”二级学科硕士点，是2006年申报并获批准、2007年开始招生。“马克思主义中国化研究”是专门研究马克思主义中国化的基本经验、基本规律以及马克思主义中国化理论成果的学科。本硕士点下设马克思主义中国化的历史进程及其规律研究、马克思主义中国化理论与现实问题研究、中国化马克思主义与青年德育研究三个研究方向。本学科点师资力量雄厚，梯队合理，现有导师12人，其中教授4人，副教授5人；博士和在读博士5人。“马克思主义中国化研究”硕士点专门培养具有坚定的马克思主义信仰和社会主义信念；比较系统地掌握马克思主义中国化的发展进程与理论成果；具有较强的学习能力和一定的科学研究能力；较熟练地掌握一门外国语并能阅读本专业的外文资料；了解本学科的最新动态；能够担任与本学科相关的教学、科研宣传、党政工作的相关人才。

近年来，马克思主义学院先后承担或完成了各类课题共43项。其中国家社会科学基金3项；省部级课题30项，厅局级课题21项。公开出版学术专著6部。参与全国统编教材及广东省统编教材6部。公开发表论文200多篇，其中约三分之一发表在《马克思主义与现实》、《毛泽东思想研究》、《学术研究》、《社会主义研究》、《江汉论坛》、《光明日报·理论版》等全国性中文核心期刊。